DNA 单词在编码序列中的过度及不足表示现的长尾特征
软凝聚态物质
2007-05-23 v1 统计力学
q-bio
摘要
我们对来自 16 条酿酒酵母染色体（Saccharomyces cerevisiae）的已知基因 DNA 序列进行了双链核苷酸的分析。我们注意到，双链核苷酸使用在基因组中的相对丰度遵循类 Levy 分布的长尾分布。我们观察到，长基因常常使用强烈过度表示或不足表示的核苷酸，而对于长度小于 300 核苷酸的短基因则未见此现象。如果对极端过度或不足表示的双链核苷酸的选择作用较强，长基因将比短基因更受自发突变的影响。
引用
@article{arxiv.cond-mat/0102348,
title = {Long-Tail Feature of DNA Words Over- and Under-Representation in Coding Sequences},
author = {A. Nowicka and M. R. Dudek and S. Cebrat and M. Kowalczuk and P. Mackiewicz and M. Dudkiewicz and D. Szczepanik},
journal= {arXiv preprint arXiv:cond-mat/0102348},
year = {2007}
}
备注
5 figures