大型酵母种群中单细胞蛋白丰度变异的遗传学
基因组学
2015-06-16 v1
摘要
许多 DNA 序列变异通过改变基因表达来影响表型。我们对这些变异的理解受到当前研究样本量的限制，以及测量对象是 mRNA 而非蛋白丰度的限制。我们开发了一种强大的方法，用于在非常大的酿酒酵母 (Saccharomyces cerevisiae) 种群中识别影响蛋白表达的遗传位点。该方法利用绿色荧光蛋白标签测量单细胞蛋白丰度。我们将此方法应用于 160 个基因，检测到的每个基因的位点数量远超以往研究。我们还观察到，影响蛋白丰度的位点与影响特定基因 mRNA 丰度的位点之间存在更紧密的对应关系。大多数位点聚集在影响多种蛋白的热点位置——在某些情况下，超过一半的被检蛋白受其影响。构成这些热点的变异对基因调控网络具有深远影响，并为理解酵母菌株间细胞生理学的遗传变异提供了见解。
引用
@article{arxiv.1307.6829,
title = {Genetics of single-cell protein abundance variation in large yeast populations},
author = {Frank W. Albert and Sebastian Treusch and Arthur H. Shockley and Joshua S. Bloom and Leonid Kruglyak},
journal= {arXiv preprint arXiv:1307.6829},
year = {2015}
}