酵母中翻译的遗传影响
基因组学
2014-09-04 v2
摘要
个体间基因表达的可遗传差异是表型变异的重要来源。遗传变异对蛋白质水平的影响与对 mRNA 水平的影响有多接近，这个问题仍然悬而未决。在此，我们通过使用核糖体谱分析 (ribosome profiling) 来考察酿酒酵母 (S. cerevisiae) 两个菌株之间的遗传差异如何影响翻译，从而解决了这个问题。在数百个基因中观察到了翻译的菌株差异。对两个菌株之间的二倍体杂交种进行的等位基因特异性测量显示，翻译的顺式作用效应数量约为 mRNA 水平观测值的一半。在亲本和杂交种中，大多数对翻译的影响幅度较小，因此 mRNA 差异的方向通常反映在一致的足迹差异中。顺式和反式作用变异对足迹水平的相对重要性与 mRNA 水平相似。有一种趋势表明，鉴于各自的 mRNA 差异，翻译导致的足迹差异比预期的要大。这与据报道的酵母物种间的翻译差异往往相反于而非加强 mRNA 差异的情况形成对比。最后，我们编目了两个酵母菌株中提前翻译终止的实例，还发现了几起错误的参考基因注释导致明显的无义突变，而这些突变实际上位于翻译基因体之外的情况。总体而言，遗传对翻译的影响微妙地调节了基因表达差异，翻译并未在 mRNA 和蛋白质水平的遗传影响之间造成强烈差异。
引用
@article{arxiv.1403.3449,
title = {Genetic influences on translation in yeast},
author = {Frank W. Albert and Dale Muzzey and Jonathan Weissman and Leonid Kruglyak},
journal= {arXiv preprint arXiv:1403.3449},
year = {2014}
}