基因多态性在芽殖酵母跨代遗传中的作用
基因组学
2019-04-04 v3 种群与进化
摘要
性状的跨代遗传可能受遗传与环境因素共同影响，但目前仍知之甚少。我们研究了基因多态性对酵母分离子跨代遗传的影响，这些分离子来源于酿酒酵母的一种实验室菌株与一种野生菌株的杂交。对于所分析的每个 SNP，在分离子群体中出现频率低于一半的亲本等位基因被称为次等位基因（MA）。我们发现 MA 在分离子中的分布是非随机的，表明存在自然选择。我们比较了高 MA 含量（MAC）的分离子与低 MAC 的分离子，发现在 14 天乙醇训练后，高 MAC 组的滞后期长度缩短更为显著。此外，经乙醇训练获得并表观遗传记忆的短滞后期，在无乙醇培养基中恢复 7 天后，高 MAC 组该记忆的丢失更为剧烈。氯化钠处理产生了类似的结果。利用公共数据集，我们发现 MAC 与数百个基因的 mRNA 表达存在关联。最后，我们发现 MAC 对具有较多已知加性数量性状基因座（QTL）的性状具有优先影响。这些结果证明了大多数 MA 具有微弱有害性，且 MAC 较高的个体或细胞维持性状遗传的能力较低，这对疾病预防与治疗以及复杂性状与疾病中的“缺失遗传率”问题具有启示意义。
引用
@article{arxiv.1302.7276,
title = {Role of genetic polymorphisms in transgenerational inheritance in budding yeast},
author = {Zuobin Zhu and Qing Lu and Dejian Yuan and Yanke Li and Xian Man and Yueran Zhu and Shi Huang},
journal= {arXiv preprint arXiv:1302.7276},
year = {2019}
}
备注
22 pages, 3 figures, 1 table, 7 supplementary tables