人类组织中的转录后调控
基因组学
2017-05-15 v2 定量方法
组织与器官
应用统计
统计方法学
摘要
转录调控与转录后调控塑造了组织类型特异性蛋白质组，但它们相对贡献仍有争议。对人类组织中决定蛋白质水平的因素的估计未区分 (i) 决定不同蛋白质丰度间变异性的因素，即均值水平变异性，与 (ii) 决定同一蛋白质在不同组织类型间生理变异性的因素，即跨组织变异性。我们试图估计转录本水平对这两个正交变异性来源的贡献，发现缩放后的 mRNA 水平可以解释大部分均值水平变异性，但不一定能解释跨组织变异性。后一估计的可靠量化受限于显著的测量噪声。然而，蛋白与 mRNA 比值表现出显著的跨组织变异性，该变异性功能协调且在不同的数据集中可重复，表明存在广泛的转录后调控。这些结果警示不要从不同细胞类型的 mRNA 倍数变化估算蛋白质倍数变化，并突出了转录后调控对塑造组织类型特异性蛋白质组的贡献。
引用
@article{arxiv.1506.00219,
title = {Post-transcriptional regulation across human tissues},
author = {Alexander Franks and Edoardo Airoldi and Nikolai Slavov},
journal= {arXiv preprint arXiv:1506.00219},
year = {2017}
}
备注
30 pages, 4 figures