转录脉冲及其导致的基因表达随机性
定量方法
2009-09-29 v1 亚细胞过程
摘要
在原核生物和真核生物中均观测到了转录脉冲现象，它在细胞间蛋白质和 mRNA 数量的变异性中起着至关重要的作用。关键问题在于与转录爆发 episode 相关的时间常数如何影响细胞 mRNA 和蛋白质分布，反之，实验观测到的分布在多大程度上可归因于转录脉冲。我们通过研究 mRNA 分布转录脉冲模型的主方程的精确时间依赖解来解决这些问题。我们发现了一系列结果：我们表明，除其他外，当速率常数在具有生物学意义的时间尺度上变化时，稳态下会出现双峰分布和长尾（幂律）分布。由于实验中可能无法达到稳态分布，我们展示了分布的时间演化结果。由于细胞行为本质上由蛋白质决定，我们研究了不同 mRNA 分布对相应蛋白质分布的影响。我们 delineate 了蛋白质分布模拟 mRNA 分布的速率常数区域，以及蛋白质分布显著偏离 mRNA 分布的区域。
引用
@article{arxiv.0711.1141,
title = {Transcriptional pulsing and consequent stochasticity in gene expression},
author = {Srividya Iyer-Biswas and F. Hayot and C. Jayaprakash},
journal= {arXiv preprint arXiv:0711.1141},
year = {2009}
}
备注
12 pages, 6 figures. Submitted to PloS Computational Biology on 10/04/2007