利用泊松过程分割求解基因表达随机模型的精确蛋白分布
分子网络
2015-06-15 v1 生物物理
摘要
基因表达中的随机性导致遗传相同细胞群体中的蛋白水平波动。此类波动可导致克隆群体的表型变异，因此利用随机模型量化基因表达噪声引起了极大关注。然而，除最简单的模型外，获取蛋白分布的精确解析结果一直是一项棘手任务。在此，我们利用泊松过程的分割性质开发了一种映射，显著简化了基因表达随机模型的分析。该映射利用基于启动子调控模型中的 mRNA 分布结果，导出了精确的蛋白分布。利用该方法，我们推导了基因表达基本两阶段模型的稳态和时间依赖分布的精确解析结果。此外，我们展示了该映射如何导出包含转录后和翻译后调控效应的基本模型扩展形式的精确蛋白分布。本文开发的方法具有广泛的适用性，有助于定量理解基因表达及其调控中的随机性。
引用
@article{arxiv.1304.6570,
title = {Exact protein distributions for stochastic models of gene expression using partitioning of Poisson processes},
author = {Hodjat Pendar and Thierry Platini and Rahul V. Kulkarni},
journal= {arXiv preprint arXiv:1304.6570},
year = {2015}
}
备注
10 pages, 5 figures