MicroRNAs优先靶向具有高转录调控复杂度的基因
基因组学
2007-05-23 v1 分子网络
摘要
过去几年中,microRNAs(miRNAs)已成为一类新的显著基因调控因子,在转录后水平负调控动物基因组中约三分之一基因的表达。然而,为何某些基因受miRNAs调控而另一些不受调控,即何种原则支配动物基因组中的miRNA调控,仍不明确。本研究中,我们系统分析了转录因子(TFs)与miRNAs在基因调控中的关系。我们发现,具有更多TF结合位点的基因有更高概率被miRNAs靶向,且平均具有更多miRNA结合位点。该观察揭示,具有更高顺式调控复杂度的基因在转录水平更受TFs协调调控,并在转录后水平更受miRNAs协调调控。这是关于基因表达协调调控机制的一个潜在新发现。基因本体分析进一步表明,此种协调调控在发育基因中更为普遍。
引用
@article{arxiv.q-bio/0701001,
title = {MicroRNAs preferentially target the genes with high transcriptional regulation complexity},
author = {Qinghua Cui and Zhenbao Yu and Youlian Pan and Enrico Purisima and Edwin Wang},
journal= {arXiv preprint arXiv:q-bio/0701001},
year = {2007}
}
备注
supplementary data available at http://www.bri.nrc.ca/wang