探究 microRNA 介导的基因表达控制极限
分子网络
2016-01-28 v1 无序系统与神经网络
生物物理
摘要
根据“ceRNA 假说”，microRNAs (miRNAs) 可能作为长编码或非编码 RNA 分子之间有效正相互作用的介质，对多种生物过程具有显著的潜在影响。受近期将小调控元件作为信息传递通道进行定量描述的工作启发，我们根据调制器（转录因子）与目标节点（长 RNA）之间可实现的最优信息流来表征 miRNA 介导调控的有效性。我们的结果表明，虽然需要足够大的靶标去抑制程度来激活 miRNA 介导的传输，但 (a) 在复杂处理和/或转录能力的差异机制情况下，通过转录后 miRNA 通道的调控可以优于通过直接转录控制实现的调控；此外，(b) 在存在大量弱相互作用 miRNA 分子时，来自滴定的额外噪声消失，使得 miRNA 通道能像直接通道一样有效地处理信息。这些观察确立了 miRNA 介导的转录后串扰的极限，并表明除了提供一定程度的噪声缓冲外，这类控制可在细胞中有效地用作故障安全机制以及基因表达的优先微调器，指出了每种功能最大化时的具体情况。
引用
@article{arxiv.1601.07191,
title = {Probing the limits to microRNA-mediated control of gene expression},
author = {Araks Martirosyan and Matteo Figliuzzi and Enzo Marinari and Andrea De Martino},
journal= {arXiv preprint arXiv:1601.07191},
year = {2016}
}
备注
16 pages