MicroRNA 作为竞争 RNA 间通信的选择性通道：稳态理论
分子网络
2015-06-11 v2 无序系统与神经网络
统计力学
生物物理
定量方法
摘要
近期有观点提出，对有限微小 RNA（miRNA）库的竞争会在其共同靶标（即竞争内源 RNA 或 ceRNA）之间产生有效的相互作用，这可能对转录后调控（PTR）至关重要。我们研究了一个 PTR 的最小模型，其中此类相互作用的出现及其性质可在稳态下得到详细刻画。敏感性分析表明，结合自由能与抑制机制是 ceRNA 间产生串扰的关键要素。相互作用出现在特定的抑制值范围内，可以是对称的（一个 ceRNA 影响另一个，反之亦然）或不对称的（一个 ceRNA 影响另一个但反之不成立），并且可能具有高度选择性，尽管可能受限于噪声。此外，我们表明，即使在没有 miRNA 介导的串扰的情况下，由于转录波动，ceRNA 之间也可能在实验读数中出现非平凡的相关性。
引用
@article{arxiv.1210.2338,
title = {MicroRNAs as a selective channel of communication between competing RNAs: a steady-state theory},
author = {Matteo Figliuzzi and Enzo Marinari and Andrea De Martino},
journal= {arXiv preprint arXiv:1210.2338},
year = {2015}
}
备注
15 pages, 10 figures, to appear in Biophys J