单细胞中 microRNA 靶标间交叉调控、噪声与同步的定量研究
分子网络
2017-04-19 v1
摘要
最近的研究报道了共同 microRNA 库靶标之间复杂的转录后相互作用，microRNA 是一类小型非编码基因表达下调因子。表现为 microRNA 海绵的不同 RNA 物种可能以剂量依赖的方式竞争结合 microRNA 并相互共调控。尽管之前在细胞群体中的研究显示了体外竞争，但该过程的详细动力学方面，尤其是在生理条件下，仍不清楚。我们通过定量单细胞测量监测共同 miRNA 的两个靶标的蛋白表达来解决这一问题。与分子滴定的详细随机模型一致，我们观察到：(i) 靶标间的串扰仅在特定的化学计量条件下才可能发生，(ii) microRNA 调控元件数量的权衡可能导致两个不同细胞群体的共存，(iii) 可观察到强烈的靶标间相关性。这种现象学与每个细胞中少量（约 10-100 个）mRNA 靶标分子相符。
引用
@article{arxiv.1503.06696,
title = {Quantitative study of crossregulation, noise and synchronization between microRNA targets in single cells},
author = {Carla Bosia and Francesco Sgrò and Laura Conti and Carlo Baldassi and Federica Cavallo and Ferdinando Di Cunto and Emilia Turco and Andrea Pagnani and Riccardo Zecchina},
journal= {arXiv preprint arXiv:1503.06696},
year = {2017}
}
备注
17 pages, 9 pdf figures, supplementary information included