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关于 microRNA 介导的前馈回路的功能特性

分子网络 2008-02-26 v2

摘要

动机:近期对基因组尺度调控网络的研究表明,前馈回路 (FFL) 电路是许多此类网络的关键组成部分。这引发了对不同 FFL 类型功能特性的研究,其中调控元件为转录因子。结果:在此,我们研究了当回路的介导调控元件为 microRNA 时的这些特性。我们发现,在这种设置下,许多 FFL 特性得到了增强。随后,我们识别了 D. Melanogaster 调控网络中所有此类 FFL。我们观察到,在以同一转录因子为根的 FFL 中,预测的转录因子结合位点数量与 microRNA 结合位点数量之间存在显著相关性。结论:基于建模方法,我们提出这些相关性可能是转录因子偏好的 FFL 类型的结果。这可能有助于阐明该转录因子所赋予的调控类型。

关键词

引用

@article{arxiv.0802.3447,
  title  = {On the functional properties of microRNA-mediated feed forward loops},
  author = {Yonatan Bilu},
  journal= {arXiv preprint arXiv:0802.3447},
  year   = {2008}
}