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通过翻译调控扩展转录因子作用的动态范围

分子网络 2016-02-10 v1

摘要

基因表达调控中的一个关键步骤是转录因子(TF)蛋白与 DNA 上调控位点的结合。但转录因子在纳摩尔浓度下发挥作用,这些分子随机到达其结合位点所产生的噪声会严重限制调控的精度。最近关于调控网络中信息流优化的研究表明,浓度动态范围的低端根本不可及,被这种噪声的影响所淹没。受同源域蛋白行为的启发,例如果蝇胚胎中的母源形态发生素 Bicoid,我们提出了一种方案,其中转录因子也充当间接的翻译调控因子,结合到其他转录因子的 mRNA 上。直观地说,每个 mRNA 分子充当 TF 浓度的独立传感器,对这些多个传感器进行平均可降低噪声。我们分析了通过这种新方案的信息流,并确定了它优于直接转录调控的条件。我们的结果表明,同源域蛋白的双重角色不仅仅是一个历史偶然,而是基因表达调控中一个关键物理问题的解决方案。

关键词

引用

@article{arxiv.1507.02562,
  title  = {Extending the dynamic range of transcription factor action by translational regulation},
  author = {Thomas R. Sokolowski and Aleksandra M. Walczak and William Bialek and Gašper Tkačik},
  journal= {arXiv preprint arXiv:1507.02562},
  year   = {2016}
}

备注

14 pages, 5 figures