利用微流体浊度计与自动化细胞追踪在单蛋白质水平上进行高通量基因表达分析
定量方法
2012-07-18 v1
摘要
我们开发了一种结合微流控、延时单分子显微镜与自动化图像分析的方法，能够在每次实验中观察超过 3000 个指数生长大肠杆菌细胞的完整细胞周期。该方法使得分析细菌细胞周期内单蛋白质水平的基因表达速率成为可能。我们还证明，利用短激发光脉冲可以计数非特异性结合 DNA 的 LacI-Venus 分子的数量。这些转录因子定位于细胞内的拟核上，并似乎均匀分布在染色体 DNA 上。在细胞周期开始时观察到 LacI 表达的增加，这可能是由于细胞分裂时的分配不均导致某些基因拷贝去阻遏。最后，我们观察到一种大小-生长速率不确定性关系：在富培养基中，细胞出生时长度的变化大于世代时间的变化；而在贫培养基中则相反。
引用
@article{arxiv.1207.4048,
title = {Hi-throughput gene expression analysis at the level of single proteins using a microfluidic turbidostat and automated cell tracking},
author = {G. Ullman and M. Wallden and E. G. Marklund and A. Mahmutovic and I. Razinkov and J. Elf},
journal= {arXiv preprint arXiv:1207.4048},
year = {2012}
}
备注
Accepted in Philosophical Transactions B