利用高通量测序在单细胞水平观测基因组动态
基因组学
2015-05-14 v1 细胞行为
摘要
随着高通量测序技术的发展，已经可以在全基因组范围内直接分析突变分布，从而将突变率测量与传统潜在假设分离开来。在此，我们对化学诱变后获得的菌落中的几个大肠杆菌基因组进行了测序，并观察到诱发的突变呈现显著的非随机分布。这些分布包括沿基因组的仅包含 G 到 A 或 C 到 T 转换的长片段，以及突变密度在基因组内和基因组间存在的数量级差异。尽管这些观察结果大部分可以通过酶促过程的已知特征来解释，但其他结果可能反映了单细胞水平分子过程的随机性。我们的结果表明，对单个诱变细胞后代基因组中留下的分子记录进行分析，如何能够在它们祖先的单个基因组中实现对突变固定与分离以及重组事件的全基因组尺度观测。
引用
@article{arxiv.0912.3093,
title = {Use of high throughput sequencing to observe genome dynamics at a single cell level},
author = {D. Parkhomchuk and V. S. Amstislavskiy and A. Soldatov and V. Ogryzko},
journal= {arXiv preprint arXiv:0912.3093},
year = {2015}
}
备注
22 pages, 9 figures (including 5 supplementary), one table