用于单分子成像的lambda-DNA自动线条追踪
生物物理
2011-02-24 v1
摘要
我们描述了一种直接的、自动化的线条追踪方法，用于在光学分辨率内可视化线性大分子在布朗扩散和外部场（如电泳）作用下随时间重塑形状的轮廓。该方法基于三个连续的分析阶段：首先，“特征发现”以区分信号与噪声；其次，“线条追踪”以将这些形状近似为线条；第三，“时间一致性检查”以在时域中区分合理与不合理的拟合构象。这种数据分析的自动化特性使得在排除不可靠部分的同时，积累大量数据变得简单直接。我们将该分析应用于琼脂糖凝胶中lambda-DNA分子的荧光图像，以证明其产生用于后续统计分析的大型数据集的能力。
引用
@article{arxiv.1102.4770,
title = {Automated Line Tracking of lambda-DNA for Single-Molecule Imaging},
author = {Juan Guan and Bo Wang and Steve Granick},
journal= {arXiv preprint arXiv:1102.4770},
year = {2011}
}