基于标记随机有限集的细胞及其谱系追踪
信号处理
2021-10-29 v3
摘要
在活细胞实验中确定细胞轨迹及其谱系或祖先关系，是理解细胞行为与分裂方式的基础。本文提出新颖的在线算法，用于从延时视频数据中联合追踪未知且时变数量的细胞并解析其谱系。我们的方法将细胞集合建模为标记随机有限集，其中标记表示细胞身份与谱系。我们建立了繁衍模型，以考虑细胞分裂前的细胞谱系及外观变化。随后推导出解析滤波器，用于传播包含当前细胞集合及其谱系信息的多目标分布。我们还开发了所得多目标滤波器的数值实现。通过仿真、合成细胞迁移视频及真实延时序列的实验，展示了该方案的能力。
引用
@article{arxiv.2104.10964,
title = {Tracking Cells and their Lineages via Labeled Random Finite Sets},
author = {Tran Thien Dat Nguyen and Ba-Ngu Vo and Ba-Tuong Vo and Du Yong Kim and Yu Suk Choi},
journal= {arXiv preprint arXiv:2104.10964},
year = {2021}
}