过度拥挤细菌群落中的单细胞追踪
计算机视觉与模式识别
2017-06-23 v1
摘要
细胞追踪能够从延时“细胞影片”中提取数据，并促进在单细胞水平上对生物过程进行建模。我们引入了一种新的全自动计算策略，用于在延时影片中跨帧准确追踪细胞。我们的方法基于动态邻域形成与匹配方法，其灵感来源于视频压缩中的运动估计算法。此外，它利用“分而治之”策略来有效解决过度拥挤细菌群落中具有挑战性的细胞追踪问题。使用由不同实验室生成的细胞影片，我们证明即使在分析大型过度拥挤的微生物群落时，所提出方法的准确率仍保持在极高水平（超过97%）。
引用
@article{arxiv.1706.07362,
title = {Tracking Single-Cells in Overcrowded Bacterial Colonies},
author = {Athanasios D. Balomenos and Panagiotis Tsakanikas and Elias S. Manolakos},
journal= {arXiv preprint arXiv:1706.07362},
year = {2017}
}