基于几何演化律最优控制的整细胞追踪
数值分析
2016-05-04 v1
摘要
能够自动化和系统化分析细胞延时图像数据集的细胞追踪算法，是模拟和理解细胞现象不可或缺的工具。在本研究中，我们提出了一种用于整细胞追踪的理论框架和算法。在本工作中，我们将“追踪”视为从静态图像数据集中动态重构整细胞数据（形态）。我们工作的新颖之处在于，该追踪算法由细胞运动模型驱动。该模型可被视为最近开发的一种具有物理意义的细胞运动模型的简化形式。由此产生的问题是几何演化律的最优控制，我们讨论了该最优控制问题的表述与数值逼近。本工作的总体目标是设计一个细胞追踪框架，使得恢复的数据能够反映前向模型的物理特性。文中展示了若干数值模拟，以说明我们方法的适用性。
引用
@article{arxiv.1504.05399,
title = {Whole cell tracking through the optimal control of geometric evolution laws},
author = {Konstantinos N. Blazakis and Anotida Madzvamuse and Constantino-Carlos Reyes-Aldasoro and Vanessa Styles and Chandrasekhar Venkataraman},
journal= {arXiv preprint arXiv:1504.05399},
year = {2016}
}