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基于生物学需求的细胞追踪——具有偶然不确定性的强有丝分裂感知多假设追踪器

计算机视觉与模式识别 2025-06-30 v5

摘要

细胞追踪与分割有助于生物学家从大规模显微延时数据中提取洞见。受局部精度指标驱动,当前追踪方法往往缺乏长期一致性以及正确重建谱系树的能力。为解决此问题,我们为运动估计框架引入一种不确定性估计技术,并扩展了多假设追踪框架。我们的不确定性估计利用特定问题的测试时增强,将运动表示提升为概率空间密度。此外,我们引入一种新颖的有丝分裂感知分配问题公式,使多假设追踪器能够对细胞分裂建模,并基于长期冲突解决错误关联和有丝分裂检测。在我们的框架中,显式的生物学知识被建模为分配代价。我们在九个竞争性数据集上评估了我们的方法,并证明在受生物学启发的指标上,我们大幅超越了当前最先进水平,取得了约6倍的改进,并揭示了关于运动估计不确定性行为的新洞见。

关键词

引用

@article{arxiv.2403.15011,
  title  = {Cell Tracking according to Biological Needs -- Strong Mitosis-aware Multi-Hypothesis Tracker with Aleatoric Uncertainty},
  author = {Timo Kaiser and Maximilian Schier and Bodo Rosenhahn},
  journal= {arXiv preprint arXiv:2403.15011},
  year   = {2025}
}

备注

19 pages, 7 figures, 6 tables. This work has been accepted to the IEEE for publication