cDNA 微阵列图像自动网格化技术
计算机视觉与模式识别
2016-07-05 v1
摘要
微阵列被认为是大规模基因序列和基因表达分析的重要工具和强大的新技术。该技术的主要挑战之一是图像处理阶段。该阶段的准确性对后续基因表达和识别分析的有效性和准确性有重要影响。处理过程主要可分为四个步骤:网格化、斑点分离、分割和量化。尽管目前已有几种商业软件包,微阵列图像分析仍需要用户进行一定程度的干预,因此需要具备一定水平的图像处理专业知识。本文描述并比较了四种执行自动网格化和斑点分离的技术。所提出的技术基于模板匹配技术、标准差、求和以及这些轮廓的导数。实验结果表明,对于质量好和质量差的微阵列图像,求和轮廓的导数方法相比其他技术具有很高的准确性。
引用
@article{arxiv.1607.00592,
title = {Automatic Techniques for Gridding cDNA Microarray Images},
author = {Naima Kaabouch and Hamid Shahbazkia},
journal= {arXiv preprint arXiv:1607.00592},
year = {2016}
}
备注
5 pages, IEEE Electro/Information Technology, 2008