纳米通道中基因组映射的标记间距分布
生物物理
2018-07-02 v2
摘要
在基因组映射实验中，长 DNA 分子被限制在极窄的通道中从而被拉伸，使得通道轴上序列特异性荧光标记的位置提供了大尺度的基因组信息。然而，将通道做得足够窄以使 DNA 分子完全拉伸是很困难的。实际上，其构象可能形成发夹结构，从而改变 DNA 分子内部片段之间的间距，进而改变通道轴上的标记位置。在此，我们描述了一个关于标记间距分布的理论，该理论解释了基因组映射实验中观察到的标记间距分布的重尾现象。
引用
@article{arxiv.1803.11396,
title = {Distribution of label spacings for genome mapping in nanochannels},
author = {D. Ödman and E. Werner and K. D. Dorfman and C. R. Doering and B. Mehlig},
journal= {arXiv preprint arXiv:1803.11396},
year = {2018}
}
备注
18 pages, 4 figures, 1 table