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论 DNA 标记的信道容量

信息论 2024-01-24 v2 math.IT

摘要

DNA 标记是分子生物学与生物技术中一种强有力的工具,可在分子水平对 DNA 进行可视化、检测与研究。在此范式下,一个 DNA 分子被特定 k 个模式标记后成像。所得图像被建模为 (k + 1) 元序列,其中任意非零符号表示 DNA 分子中对应标记的出现。本工作的主要目标是研究标记容量,其定义为利用该标记过程可获得的最大信息率。我们针对单一标记计算了标记容量,并针对多标记给出了若干结果。此外,我们给出了为获得标记容量 2 所需的长度为 1 或 2 的标记的最优最小数量。

关键词

引用

@article{arxiv.2305.07992,
  title  = {On the Capacity of DNA Labeling},
  author = {Dganit Hanania and Daniella Bar-Lev and Yevgeni Nogin and Yoav Shechtman and Eitan Yaakobi},
  journal= {arXiv preprint arXiv:2305.07992},
  year   = {2024}
}