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JUMP-Means:马尔可夫跳跃过程的小方差渐近

机器学习 2015-06-08 v3 机器学习

摘要

马尔可夫跳跃过程(MJP)被用于建模从疾病进展到 RNA 路径折叠的广泛现象。然而,参数模型的最大似然估计会导致退化轨迹,且在非参数模型中推断性能较差。我们采用小方差渐近(SVA)方法来克服这些局限。我们推导了直接观测和隐状态模型的参数与非参数 MJP 的小方差渐近。在参数情形下,我们获得了一种新颖的目标函数,其导致非退化轨迹。为了推导非参数版本,我们引入了 gamma-gamma 过程,这是对 gamma-exponential 过程的新颖扩展。我们为这些公式提出了算法,称之为 JUMP-means。我们的实验表明,在速度和重建精度方面,JUMP-means 与广泛使用 MJP 推断方法相比具有竞争力或优于它们。

关键词

引用

@article{arxiv.1503.00332,
  title  = {JUMP-Means: Small-Variance Asymptotics for Markov Jump Processes},
  author = {Jonathan H. Huggins and Karthik Narasimhan and Ardavan Saeedi and Vikash K. Mansinghka},
  journal= {arXiv preprint arXiv:1503.00332},
  year   = {2015}
}

备注

In Proceedings of the 32nd International Conference on Machine Learning (ICML 2015)