推断 B 细胞受体库多样性背后的过程
种群与进化
2016-02-10 v2 基因组学
摘要
我们利用高通量 DNA 序列受体库的概率推断方法，量化了人类 B 细胞中的 VDJ 重组和体细胞超突变过程。我们的分析捕捉了初始受体库的统计特性，首先是其通过 VDJ 重组初始生成后，然后是经过功能性选择后。我们还推断体细胞超突变机制的统计特性（不包括随后的选择效应）。我们的主要结果如下：由于更长的连接区插入，B 细胞受体库比 T 细胞受体库具有显著更高的多样性；通过初始选择的序列的特征在于其在 VDJ 重组事件中生成的概率更高；体细胞超突变沿 V 基因呈非均匀分布，这可以通过超突变位点周围序列上下文的独立位点模型很好地解释。
引用
@article{arxiv.1502.03136,
title = {Inferring processes underlying B-cell repertoire diversity},
author = {Yuval Elhanati and Zachary Sethna and Quentin Marcou and Curtis G. Callan and Thierry Mora and Aleksandra M. Walczak},
journal= {arXiv preprint arXiv:1502.03136},
year = {2016}
}
备注
acknowledgement added