斑马鱼B细胞VDJ使用相关性的多尺度模型

斑马鱼（\emph{Danio rerio}）是免疫学研究的模式动物之一，因为其适应性免疫系统的动力学与高等动物相似。本文建立了一个多尺度模型来模拟斑马鱼初级和次级免疫反应中B细胞的动力学。我们利用该模型解释了个体斑马鱼B细胞库VDJ使用之间报告的相关性。我们使用一个延迟常微分方程系统来模拟斑马鱼6个月寿命中的免疫反应。该平均场理论给出了感染期间高亲和力B细胞数量随时间的变化。这些B细胞的序列随后取自一个由“微观”随机能量模型计算出的分布。这个广义$NK$模型表明，针对一种抗原的成熟B细胞主要具有单个VDJ重组。该模型允许从第一性原理计算两个斑马鱼对相同抗原反应时选择相同VDJ重组的概率$p$。该概率$p$随B细胞群体大小和B细胞选择强度增加而增加，随B细胞超突变率增加而减小。该多尺度模型预测的斑马鱼免疫系统相关性高度类似于实验结果。