一种用于全生物 X 射线微 CT 扫描中细胞核计数的自适应优化算法
定量方法
2021-12-21 v1
摘要
活体生物主要由细胞构成。识别细胞并刻画其几何形态与空间分布是构建这些生物材料多尺度模型的第一步。我们提出一种利用斑马鱼 X 射线微层析扫描中的细胞核来计数细胞的方法。为考虑扫描伪影与部分体积效应，该方法使用从手动选取并优化的特例流形中近似得到的参数进行自适应校准。该方法论在不用年龄斑马鱼幼虫眼睛中的细胞核上进行了测试。
引用
@article{arxiv.2112.10670,
title = {An adaptively optimized algorithm for counting nuclei in X-ray micro-CT scans of whole organisms},
author = {Anna Madra and Alex YS. Lin and Daniel J. Vanselow and Keith C. Cheng},
journal= {arXiv preprint arXiv:2112.10670},
year = {2021}
}