海藻糖、麦芽糖和蔗糖如何影响溶菌酶的若干结构与动力学性质？——来自分子动力学模拟的见解
化学物理
2007-06-12 v1 软凝聚态物质
生物大分子
摘要
通过在 37–60 wt % 浓度范围内的分子动力学计算机模拟, 研究了三种著名的二糖——海藻糖、麦芽糖和蔗糖——对溶菌酶若干结构与动力学性质的影响. 结果发现, 糖对蛋白质构象的影响相对较弱, 这与溶菌酶的优先水合作用一致. 相反, 糖似乎显著延长了蛋白质的弛豫时间. 这些效应被证明与溶菌酶残基的溶剂可及性分数相关, 进一步支持蛋白质动力学的"受役"机制. 此外, 在所研究的浓度范围内, 溶菌酶、糖和水分子的弛豫时间均显著增加, 这可能源于糖分子氢键网络的逾渗. 该逾渗对于解释糖对溶菌酶和水动力学性质的影响似乎至关重要.
引用
@article{arxiv.0706.1492,
title = {How do trehalose, maltose and sucrose influence some structural and dynamical properties of lysozyme ? An insight from Molecular Dynamics simulations},
author = {A. Lerbret and P. Bordat and F. Affouard and A. Hedoux and Y. Guinet and M. Descamps},
journal= {arXiv preprint arXiv:0706.1492},
year = {2007}
}