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水合溶菌酶粉末单粒子弛豫中的对数衰减

软凝聚态物质 2015-05-13 v1

摘要

我们通过分子动力学(MD)模拟,展示了水合溶菌酶粉末在生理温度附近蛋白质氨基酸的自动力学。氨基酸残基质心以及蛋白质氢原子的自中间散射函数(SISF)在从2皮秒到2纳秒的3个时间量级内呈现对数衰减,随后是指数型的α\alpha-弛豫。这种慢动力学类似于模式耦合理论(MCT)在更高阶奇点附近预测的β\beta-弛豫时间范围内的弛豫情景。这些结果表明,蛋白质的单粒子动力学与胶体、聚合物和分子玻璃形成液体的动力学之间存在很强的类比性。

关键词

引用

@article{arxiv.0908.1910,
  title  = {Logarithmic decay in single-particle relaxations of hydrated lysozyme powder},
  author = {Marco Lagi and Piero Baglioni and Sow-Hsin Chen},
  journal= {arXiv preprint arXiv:0908.1910},
  year   = {2015}
}

备注

4 pages, 5 figures