带池核糖体流模型的几何稳定性考量
亚细胞过程
2016-10-14 v1 动力系统
摘要
为了更好地理解基因翻译过程，最近引入了带池核糖体流模型（RFM）。该模型描述了多个核糖体沿 mRNA 模板的移动，并同时刻画了有限核糖体池的动力学。迄今，基于单调系统理论（Margaliot 和 Tuller, 2012）研究该系统关于其平衡点的数量与稳定性。我们通过使用几何方法扩展了其中所得的结果，表明系统的平衡点构成一个正规双曲不变子流形。随后，我们分析了在平衡点处求值的系统 Jacobi 线性化，以证明平衡点相对于特定仿射子空间是渐近稳定的。由于该方法不要求系统具备任何单调性特征，因此它也可应用于同类的更复杂系统，如双向核糖体流或时变模板数。
引用
@article{arxiv.1610.03986,
title = {Geometric stability considerations of the ribosome flow model with pool},
author = {Wolfgang Halter and Jan Maximilian Montenbruck and Frank Allgöwer},
journal= {arXiv preprint arXiv:1610.03986},
year = {2016}
}
备注
Published in the Proceedings of the 22nd International Symposium on the Mathematical Theory of Networks and Systems, 2016, http://hdl.handle.net/11299/181518