通过保守的氨基酸残基进化模式表征结合ACE2的SARS-CoV与SARS-CoV-2
生物大分子
2020-12-23 v2
摘要
刺突(S)糖蛋白介导冠状病毒进入宿主细胞。S蛋白的S1亚基包含受体结合域(RBD)，能够识别不同的宿主受体，突显其在病毒进化过程中适应宿主的显著能力。虽然 spike 蛋白中的RBD对病毒-受体相互作用具有决定性，但活性残基位于受体结合基序(RBM)——RBD中一个在其受体外表面结合中起基本作用的区域。在此，我们提出假设：能够利用血管紧张素转换酶2(ACE2)蛋白的SARS-CoV和SARS-CoV-2毒株在病毒进化过程中调整了其RBM，以探索由残基YGF驱动的特定构象拓扑来感染宿主细胞。我们还推测，这种基于YGF的机制可作为位于RBM的蛋白特征，用于区分能够利用ACE2作为细胞进入受体的冠状病毒。
引用
@article{arxiv.2008.12830,
title = {Featuring ACE2 binding SARS-CoV and SARS-CoV-2 through a conserved evolutionary pattern of amino acid residues},
author = {Patrícia P. D. Carvalho and Nelson A. Alves},
journal= {arXiv preprint arXiv:2008.12830},
year = {2020}
}
备注
12 pages, 6 figures