通过分子动力学模拟探究 SARS-CoV-2 刺突蛋白 N 端结构域的调控功能
生物大分子
2021-01-07 v1
摘要
SARS-CoV-2 是引发 COVID-19 大流行的病原体。早期病毒感染由 SARS-CoV-2 同源三聚体刺突（S）蛋白介导，其受体结合结构域（RBDs）处于受体可接近状态。我们对 S 蛋白进行了分子动力学模拟，重点研究其 N 端结构域（NTDs）的功能。我们的研究表明，NTD 充当“楔子”角色，并在 S 蛋白的构象变化中发挥关键的调控作用。仅当作为楔子通常阻碍 RBD 运动的相邻 NTD 脱离并摆开时，完整的 RBD 结构转变才被允许。基于该 NTD“楔子”模型，我们提出 NTD-RBD 界面应是一个潜在的药物靶点。
引用
@article{arxiv.2101.01884,
title = {Exploring the Regulatory Function of the N-terminal Domain of SARS-CoV-2 Spike Protein Through Molecular Dynamics Simulation},
author = {Yao Li and Tong Wang and Juanrong Zhang and Bin Shao and Haipeng Gong and Yusong Wang and Siyuan Liu and Tie-Yan Liu},
journal= {arXiv preprint arXiv:2101.01884},
year = {2021}
}