SARS-CoV-2 刺突蛋白中环区的构象变异性
生物大分子
2021-10-14 v2 应用统计
摘要
SARS-CoV-2 刺突（S）蛋白介导病毒感染，并已成为众多结构测定工作的焦点。其柔性环区已知参与蛋白结合，并可能采取多种构象。本文基于可用的蛋白质数据库（PDB）结构识别S蛋白环区并研究其构象变异性。尽管多数环区基本只有一种稳定构象，基于聚类分析观察到44个环区中的17个在结构上具有变异性并呈现多个实质不同的构象。随后将环建模方法应用于S蛋白环靶标，并依据所识别构象聚类的特征讨论预测精度。发现具有多种构象的环区基于单一结构模板难以建模。
引用
@article{arxiv.2105.08835,
title = {Conformational variability of loops in the SARS-CoV-2 spike protein},
author = {Samuel W. K. Wong and Zongjun Liu},
journal= {arXiv preprint arXiv:2105.08835},
year = {2021}
}
备注
24 pages