SARS-CoV-2 采用基于两种受体的策略的计算机模拟证据
生物物理
2021-06-10 v2 生物大分子
种群与进化
摘要
我们提出了一种新颖的数值方法，能够高效且有效地确定蛋白质表面片段间的互补关系。这一基于以 2D Zernike 多项式表示分子等电子密度表面的创新通用方法，可实现相互作用蛋白质间几何形状互补性的快速定量评估，这是先前方法无法做到的。我们首先用大型已知蛋白质复合物数据集测试该方法，在结合位点盲识别中获得 0.76 的 ROC 曲线下总面积，随后将其应用于研究 SARS-Cov-2 刺突蛋白与人类细胞受体相互作用的特征。我们的结果表明 SARS-CoV-2 使用双重策略：除已知的与血管紧张素转换酶 2 相互作用外，其刺突蛋白还可能与上呼吸道细胞的唾液酸受体相互作用。
关键词
引用
@article{arxiv.2003.11107,
title = {In-Silico evidence for two receptors based strategy of SARS-CoV-2},
author = {Edoardo Milanetti and Mattia Miotto and Lorenzo Di Rienzo and Michele Monti and Giorgio Gosti and Giancarlo Ruocco},
journal= {arXiv preprint arXiv:2003.11107},
year = {2021}
}
备注
10 pages, 4 figures