SARS-CoV-2 与 SARS-CoV 受体结合域中结合相互作用的比较
生物物理
2020-04-07 v1
摘要
COVID-19 自中国武汉出现以来，因其高感染率已成为重大关切，全球感染人数逾百万。大量研究试图揭示 SARS-CoV-2 相较于 SARS-CoV-1 的结构，以抑制此高感染率。其中部分研究表明，SARS-CoV-1 刺突蛋白中的突变可能为其对人 ACE2 细胞受体更高亲和力所负责。本工作中，我们使用分子动力学模拟与蒙特卡洛采样，比较 SARS-CoV 与 SARS-CoV-2 刺突蛋白对 ACE2 的结合亲和力。我们发现，由于静电相互作用增强，SARS-CoV-2 对 ACE2 的结合强于 SARS-CoV 达 7 kcal/mol。静电结合能的主要贡献来自：SARS-CoV 中 R426 与 ACE2-E329 之间，以及 SARS-CoV-2 中 K417 与 ACE2-D30 之间形成的盐桥。此外，单个突变对结合能无显著贡献。然而，这些突变引发了复杂的结构变化，从而增强了结合能。我们的结果也表明，SARS-CoV-2 不太可能是实验室 engineered 病毒。
引用
@article{arxiv.2004.02158,
title = {Comparing the binding interactions in the receptor binding domains of SARS-CoV-2 and SARS-CoV},
author = {Muhamed Amin and Mariam K. Sorour and Amal Kasry},
journal= {arXiv preprint arXiv:2004.02158},
year = {2020}
}