新的 SARS-CoV-2 毒株因 N501Y 突变显示出对 ACE2 更强的结合亲和力
生物物理
2021-01-07 v1 计算物理
生物大分子
摘要
SARS-CoV-2 因其传播速度远快于 SARS-CoV 而成为全球性挑战，这归因于受体结合域(RBD)中的突变。这些突变增强了静电相互作用。最近，英国报道了一种新毒株，其在 RBD 中包含一处突变(N501Y)，可能提高了感染率。利用分子动力学模拟(MD)和蒙特卡洛(MC)采样，我们表明 N501 突变由于 SARS-CoV-2-T500 与 ACE2-D355 在突变位点附近形成强氢键而增强了静电相互作用。此外，我们观察到野生型和突变型中 SARS-CoV-2 与 ACE2 之间的静电相互作用主要由 SARS-CoV-2-K417 与 ACE2-D30、SARS-CoV-2-K458 与 ACE2-E23、以及 SARS-CoV-2-R403 与 ACE2-E37 之间形成的盐桥主导。这些相互作用贡献了总结合能的 40% 以上。
引用
@article{arxiv.2101.01791,
title = {The New SARS-CoV-2 Strain Shows a Stronger Binding Affinity to ACE2 Due to N501Y Mutation},
author = {Fedaa Ali and Amal Kasry and Muhamed Amin},
journal= {arXiv preprint arXiv:2101.01791},
year = {2021}
}