基于病毒信息学的 SARS-CoV-2 核心蛋白潜在治疗靶点研究
生物大分子
2020-09-29 v1
摘要
由于 SARS-CoV-2（严重急性呼吸综合征冠状病毒 2）是一种新型病毒，目前尚无已知能有效减缓其进展的抗病毒药物。为加速潜在候选药物的发现，基于生物信息学的计算机药物发现可作为一种非常稳健的工具。在本研究中，经文献调研后选择了市场上已有的 60 多种抗病毒药物。这些药物可用于 COVID-19 治疗的临床试验。本研究基于这些候选药物与 SARS-CoV-2 的刺突蛋白和 RdRp（RNA 依赖的 RNA 聚合酶）相互作用的潜力对其进行排序。此外，还解释了它们的作用机制，以及病毒感染如何利用血红蛋白降低血液中氧水平。而且，对刺突蛋白与正冠状病毒亚科中 75 条不同病毒的序列进行了多序列比对。这揭示了可利用药物或抗体治疗靶向的进化保守结构域。这一多维研究为理解 SARS-CoV-2 刺突蛋白上最有效药物可靶向位点开辟了新层面。
引用
@article{arxiv.2009.12817,
title = {Viroinformatics-based investigation of SARS-CoV-2 core proteins for potential therapeutic targets},
author = {Lokesh Agrawal and Thanasis Poullikkas and Scott Eisenhower and Carlo Monsanto and Ranjith Kumar Bakku},
journal= {arXiv preprint arXiv:2009.12817},
year = {2020}
}