解码 SARS-CoV-2 的传播、演化及其对 COVID-19 诊断、疫苗和药物的影响
基因组学
2020-04-30 v1 种群与进化
摘要
为应对由严重急性呼吸综合征冠状病毒2（SARS-CoV-2）引起的2019冠状病毒病（COVID-19），人们在诊断检测、预防性疫苗和治疗药物的开发上付出了巨大努力。这些开发大多基于2020年1月5日收集的参考基因组。基于对截至2020年4月24日收集的6156个基因组样本的基因分型，我们报告 SARS-CoV-2 已发生4459个惊人的突变，可聚为五种亚型。我们引入突变率和突变 -指数来表征蛋白保守性，并揭示 SARS-CoV-2 包膜蛋白、主蛋白酶和内切核糖核酸酶蛋白相对保守，而 SARS-CoV-2 核衣壳蛋白、刺突蛋白和木瓜样蛋白酶相对不保守。特别是，核衣壳蛋白在过去几个月中超过一半的基因发生改变，这预示着对正在进行的 COVID-19 诊断、疫苗和药物开发具有破坏性影响。
引用
@article{arxiv.2004.14114,
title = {Decoding SARS-CoV-2 transmission, evolution and ramification on COVID-19 diagnosis, vaccine, and medicine},
author = {Rui Wang and Yuta Hozumi and Changchuan Yin and Guo-Wei Wei},
journal= {arXiv preprint arXiv:2004.14114},
year = {2020}
}
备注
23 pages, 13 figures and 13 tables