SARS-CoV-2所用细胞进入系统中的短线性基序候选及其潜在治疗意义
生物大分子
2021-01-14 v1
摘要
SARS-CoV-2的主要细胞表面受体是血管紧张素转换酶2(ACE2)。最近注意到病毒刺突蛋白具有RGD基序，表明细胞表面整合素可能作为共受体。我们使用真核线性基序资源ELM检查了ACE2和整合素的序列，并在其短而无结构的胞质尾中发现了候选短线性基序(SLiMs)，这些基序在内吞作用、膜动力学、自噬、细胞骨架和细胞信号传导中具有潜在作用。这些SLiM候选在脊椎动物中高度保守。它们提示了与AP2 mu2亚基以及存在于肺上皮细胞的信号和调节蛋白中的I-BAR、LC3、PDZ、PTB和SH2结构域的潜在相互作用。若干基序在尾序列中重叠，表明它们可能作为分子开关发挥作用，且常涉及酪氨酸磷酸化状态。ACE2和整合素β3的尾中存在候选LIR基序，表明这些蛋白可直接招募自噬组分。我们还注意到ACE2的胞外部分具有保守的MIDAS结构基序，该基序通常被β整合素用于配体结合，可能支持整合素与ACE2共享共同配体的提议。本文所述的发现确定了若干分子联系和可检验的假设，可能有助于揭示SARS-CoV-2附着、进入和复制的机制，并加强了开发宿主导向疗法以降低病毒进入效率和阻碍疾病进展的可能性。强烈的序列保守性意味着这些推定的SLiM是良好的候选者：然而，SLiM在被确认具有功能之前必须始终通过实验验证。
引用
@article{arxiv.2004.10274,
title = {Short linear motif candidates in the cell entry system used by SARS-CoV-2 and their potential therapeutic implications},
author = {Bálint Mészáros and Hugo Sámano-Sánchez and Jesús Alvarado-Valverde and Jelena Čalyševa and Elizabeth Martínez-Pérez and Renato Alves and Manjeet Kumar and Friedrich Rippmann and Lucía B. Chemes and Toby J. Gibson and .},
journal= {arXiv preprint arXiv:2004.10274},
year = {2021}
}
备注
38 pages, 7 figures, 2 tables. Corresponding authors are Luc\'ia B. Chemes, Toby J. Gibson