easyGWAS：一个用于执行全基因组关联研究的集成跨物种平台
基因组学
2012-12-20 v1 计算工程、金融与科学
数字图书馆
应用统计
摘要
动机：动植物全基因组关联研究（GWAS）的快速增长催生了对一个中心资源的需求，该资源能够促进 i) 执行 GWAS，ii) 访问其他 GWAS 的数据和结果，以及 iii) 使所有用户，无论其背景如何，都能利用最新的统计技术，而无需管理复杂的软件和计算资源。结果：我们推出 easyGWAS，这是一个网络平台，提供执行和分析 GWAS 的方法、工具和动态可视化功能。此外，easyGWAS 使得重现他人的结果、验证发现以及通过合并公共数据集获取更大样本量变得简单。可用性：详细的方法和数据描述以及教程可在补充材料中获得。easyGWAS 可在 http://easygwas.tuebingen.mpg.de/ 访问。联系方式：[email protected]
引用
@article{arxiv.1212.4788,
title = {easyGWAS: An integrated interspecies platform for performing genome-wide association studies},
author = {Dominik Grimm and Bastian Greshake and Stefan Kleeberger and Christoph Lippert and Oliver Stegle and Bernhard Schölkopf and Detlef Weigel and Karsten Borgwardt},
journal= {arXiv preprint arXiv:1212.4788},
year = {2012}
}