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面向非线性异质转录组范围关联的统一分位数框架

统计方法学 2024-12-10 v3 应用统计

摘要

转录组范围关联研究(TWAS)通过整合全基因组关联研究与基因表达数据,是识别基因水平关联的有力工具。然而,大多数TWAS方法聚焦于基因与性状间的线性关联,忽略了生物系统中可能存在的复杂非线性关系。为克服该局限,我们提出一种新框架QTWAS,其将基于分位数的基因表达模型整合进TWAS模型,从而能够发现非线性且异质的基因-性状关联。通过全面的模拟以及对连续与二值性状的应用,我们证明所提模型在识别基因-性状关联方面比常规TWAS更具功效。

关键词

引用

@article{arxiv.2207.12081,
  title  = {A unified quantile framework for nonlinear heterogeneous transcriptome-wide associations},
  author = {Tianying Wang and Iuliana Ionita-Laza and Ying Wei},
  journal= {arXiv preprint arXiv:2207.12081},
  year   = {2024}
}