启动子活性与其间隔区核苷酸位置的相关性
基因组学
2015-03-13 v1 生物物理
摘要
转录是细胞读取基因中编码的遗传信息的基本过程之一，由RNA聚合酶与相关启动子的结合所启动。实验发现启动子的核苷酸序列对基因表达强度（即启动子活性）有很大影响。在合成生物学中，一个有趣的问题是如何合成具有给定活性的启动子，以及启动子序列的哪些位置对决定其活性至关重要。本研究基于近期实验数据，采用多种方法分析了启动子活性与其序列位置之间的相关性。我们的结果表明，除两个高度保守区域（框和框）中的核苷酸外，其他位置核苷酸的影响也不可忽略。例如，间隔区中位置 附近的核苷酸修饰可能大幅改变启动子活性。本研究结果可能有助于我们理解基因转录的生物物理机制，并可能有助于合成细胞工厂的设计。
引用
@article{arxiv.1503.03550,
title = {Correlations between promoter activity and its nucleotide positions in spacing region},
author = {Jingwei Li and Yunxin Zhang},
journal= {arXiv preprint arXiv:1503.03550},
year = {2015}
}