启动子架构对基因表达细胞间变异性的影响
分子网络
2015-05-19 v1
摘要
根据最近的实验证据，启动子的架构——定义为控制启动子的操纵子的数量、强度和调控作用——在决定基因表达的细胞间变异性水平中起着主要作用。这些定量实验要求进行相应的建模工作，以系统而非逐例的方式解决启动子架构变化如何影响基因表达噪声的问题。在本文中，我们基于一个包含随机效应的简单基因调控微观模型，进行了这样的系统研究。特别地，我们展示了操纵子强度和操纵子多重性如何影响这种变异性。我们考察了转录因子与复杂启动子结合的不同模式（协同、独立、同时），以及每种模式如何影响细胞间转录产物的变异性水平。我们提出，将体内单细胞实验与每个细胞 mRNA 数量概率分布矩的理论预测进行直接比较，可以区分不同的基因调控动力学模型。
引用
@article{arxiv.1008.1932,
title = {Effect of promoter architecture on the cell-to-cell variability in gene expression},
author = {Alvaro Sanchez and Hernan Garcia and Daniel Jones and Rob Phillips and Jane' Kondev},
journal= {arXiv preprint arXiv:1008.1932},
year = {2015}
}
备注
35 pages, 6 figures, Submitted