转录依赖的基因位点空间组织
分子网络
2021-01-01 v1
摘要
人们日益认识到基因功能与染色体的动态结构相关联。在此我们探究三维结构与转录活性在单细胞水平上的相互作用。我们表明非活性位点比活性位点在空间上更紧凑，且在活性位点内驱动转录的增强子离启动子最近。另一方面，即使这一最短距离在位点转录活跃时也过长，无法支持增强子-启动子对之间的直接物理接触。对增强子与启动子间基因组间隔的人工操控引起物理距离与转录活性的变化，重现了野生型胚胎中观察到的相关性，但拓扑结构域边界的破坏无影响。我们的结果表明转录与顺式调控元件的空间组织之间存在复杂的相互依赖关系。
引用
@article{arxiv.2012.15819,
title = {Transcription-dependent spatial organization of a gene locus},
author = {Lev Barinov and Sergey Ryabichko and William Bialek and Thomas Gregor},
journal= {arXiv preprint arXiv:2012.15819},
year = {2021}
}