转录调控网络的大规模逻辑-化学结构
分子网络
2007-05-23 v1 无序系统与神经网络
摘要
生物系统的同一性、对外部刺激的响应以及空间结构是当前分子生物学的核心课题。目前,它们很大程度上被视为基因库与细胞调控机制之间相互作用的结果。在转录水平上,顺式调控区建立了转录因子与基因(包括其他转录因子)之间的一组相互依赖关系。这些“转录网络”过于庞大,无法通过详细的动力学模型从全局上处理。在本文中,我们描述一种仅关注基因表达模式与信号整合函数之间兼容性的方法来解决该问题,讨论了在模型最简单的布尔实现上进行的计算,以及针对实验数据集的首次应用。
引用
@article{arxiv.q-bio/0502017,
title = {The large-scale logico-chemical structure of a transcriptional regulation network},
author = {M. Cosentino Lagomarsino and P. Jona and B. Bassetti},
journal= {arXiv preprint arXiv:q-bio/0502017},
year = {2007}
}