转录网络的逻辑骨架

在转录网络粗粒度模型的研究中，很大一部分努力用于分析其动力学特征。在这封信中，我们考虑此类系统的平衡性质，表明所有动力学描述背后的逻辑骨架具有计算优化问题的结构。它涉及对应于基因表达水平的变量，以及描述顺式调控信号整合函数效应的约束。在布尔变量和信号整合函数的简单范式情况下，我们推导并讨论了相图。值得注意的是，该模型表现出从简单但不确定的基因控制状态到复杂组合控制状态的连通性转变。