变化环境下转录起始模型的集体性质
细胞行为
2015-08-11 v1
摘要
基因转录的动力学在真核生物中受到严格调控。最近的实验揭示了多种转录动力学，例如涉及转录起始阶段调控的 RNA 聚合酶 II 暂停，并且不同调控模式的选择与目标基因的生理功能密切相关。在此，我们考虑一个简化的转录起始模型，该过程包括转录复合物的组装以及 RNA 聚合酶 II 的暂停与释放。聚焦于群体水平上的集体行为，我们探索该模型所能提供的潜在调控功能。这些功能包括对环境变化的快速同步响应，或关于转录状态的长期记忆。作为概念验证，我们还表明通过选择不同的控制机制，细胞可以适应不同的环境。这些发现可能有助于我们更好地理解转录调控的设计原则。
引用
@article{arxiv.1508.02172,
title = {Collective Properties of a Transcription Initiation Model under Varying Environment},
author = {Yucheng Hu and John Lowengrub},
journal= {arXiv preprint arXiv:1508.02172},
year = {2015}
}