对 Yu 等人《酵母相互作用组网络的高质量二元蛋白质相互作用图谱》的评论 (Science 322, 104, 2008)
分子网络
2009-01-06 v1 数据分析、统计与概率
定量方法
摘要
我们检验了 Yu 等人在 Science 322, 104 (2008) 中提出的主张，即酵母 (Saccharomyces cerevisiae) 蛋白质相互作用网络的度分布最接近幂律分布。Yu 等人考虑了该网络的三个版本。然而，在所有三种情况下，我们发现数据最可能的幂律模型与 Yu 等人给出的模型不同且不相容。只有一个网络对任何幂律模型都提供了良好的统计支持，并且在这种情况下，幂律仅解释了节点度分布中前 10% 的分布。这些结果表明，酵母相互作用组中存在的结构比 Yu 等人所暗示的要多得多，并且这些网络可能不应被称为“无标度”。
引用
@article{arxiv.0901.0530,
title = {Comment on Yu et al., "High Quality Binary Protein Interaction Map of the Yeast Interactome Network." Science 322, 104 (2008)},
author = {Aaron Clauset},
journal= {arXiv preprint arXiv:0901.0530},
year = {2009}
}
备注
4 pages, 2 figures, 1 table