基于角色相似性的网络系统功能预测：在酵母蛋白质组中的应用
分子网络
2007-05-23 v1 其他凝聚态物理
其他定量生物学
摘要
我们提出了一种通用的方法来预测顶点的功能，其前提是：1. 网络的连接方式在某种程度上与顶点功能相关。2. 一部分顶点已被功能分类。该方法受到社交网络分析中角色相似性度量的影响。我们预测方案的两种版本在模型网络上进行了测试，其中顶点的功能被设计为与其网络环境相匹配。我们还将这些方法应用于酿酒酵母的蛋白质组，并发现结果与更专业的方法兼容。
引用
@article{arxiv.q-bio/0503010,
title = {Role-similarity based functional prediction in networked systems: Application to the yeast proteome},
author = {Petter Holme and Mikael Huss},
journal= {arXiv preprint arXiv:q-bio/0503010},
year = {2007}
}