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蛋白质复合物网络的研究

无序系统与神经网络 2009-11-10 v3 统计力学 分子网络

摘要

芽殖酵母{\it 酿酒酵母}是第一个基因组被完全测序的真核生物。它也是第一个蛋白质组(所有蛋白质的集合)和相互作用组(蛋白质之间所有相互作用的网络)被分析的真核细胞。在本文中,我们研究了酵母蛋白质复合物网络的结构,其中复合物之间的加权边代表共享蛋白质的数量。研究发现,蛋白质复合物网络是一个小世界网络,其许多分布具有无标度行为。然而,我们发现相邻复合物的权重和度之间没有强相关性。为了揭示网络的非随机特征,我们还将其与一个零模型进行了比较,在该模型中复合物随机选择其蛋白质。最后,我们提出了一个基于蛋白质复制和趋异的简单演化模型。

关键词

引用

@article{arxiv.cond-mat/0304207,
  title  = {Investigation of a Protein Complex Network},
  author = {A. R. Mashaghi and A. Ramezanpour and V. Karimipour},
  journal= {arXiv preprint arXiv:cond-mat/0304207},
  year   = {2009}
}

备注

19 pages, 9 figures, 1 table, to appear in Euro. Phys. J. B